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Package: perm (0.4.0-8) [debports]

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mappatura efficiente di letture brevi con semi spaziati periodicamente

PerM è un pacchetto software che è stato progettato per eseguire allineamenti a livello di genoma estremamente efficienti per centinaia di milioni di letture brevi prodotte da piattaforme di sequenziamento ABI SOLiD e Illumina. Attualmente PerM è in grado di fornire sensibilità totale per allineamenti con fino a 4 non corrispondenze per letture SOLiD di 50 pb e 9 non corrispondenze per letture Illumina di 100 pb.

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