Package: nanopolish (0.14.0-1 and others) [debports]

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identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori

Nanopolish usa un modello di Markov nascosto segnale-livello per l'identificazione di sequenze di consenso di dati di sequenziamento a nanopori di genomi. Può eseguire l'analisi a livello di segnale di dati di sequenziamento Oxford Nanopore. Nanopolish può calcolare una sequenza di consenso migliorata per una bozza di assemblaggio genomico, rilevare modificazioni di basi, identificare SNP e indel in rapporto ad un genoma di riferimento e altro ancora.

Other Packages Related to nanopolish

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

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• dep: libgomp1 (>= 6)

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• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

• dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)

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• dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)

  fast integer compression in C using the StreamVByte codec

• dep: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

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• rec: python3-pysam

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• sug: make

  utilità per guidare la compilazione

• sug: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.14.0-1+b1	2,133.7 kB	9,606.0 kB	[list of files]