Package: sibelia (3.0.7+dfsg-4)

[ Source: sibelia  ]

Experimental package

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strumento per genomica comparativa

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) è uno strumento per genomica comparativa: assiste i biologi nell'analisi di variazioni genomiche che correlano con patogeni o dei cambiamenti genomici che aiutano i microorganismi ad adattarsi ad ambienti diversi. Sibelia è anche d'aiuto per gli studi evoluzionistici e di riarrangiamento genomico per ceppi multipli di microorganismi.

Sibelia è utile per trovare:

 1) regioni condivise;
 2) regioni che sono presenti in un gruppo di genomi, ma non in altri;
 3) riarrangiamenti che trasformano un genoma in altri genomi.

Other Packages Related to sibelia

• dep: lagan

  strumento estremamente parametrizzabile per allineamento globale di coppia di sequenze genomiche

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: sibelia-examples

  strumento per genomica comparativa (dati d'esempio)

Download sibelia

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	342.2 kB	1,223.0 kB	[list of files]