[ ソース: sibelia ]
パッケージ: sibelia (3.0.7+dfsg-4)
sibelia に関するリンク
Debian の資源:
sibelia ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioinf.spbau.ru]
類似のパッケージ:
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
comparative genomics tool
Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.
Sibelia is useful in finding:
1) shared regions, 2) regions that present in one group of genomes but not in others, 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.
その他の sibelia 関連パッケージ
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- dep: lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
- fast suffix array construction
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- sug: sibelia-examples
- comparative genomics tool (example data)