selezione HPC di modelli di sostituzione di nucleotide
jModelTest è uno strumento per eseguire la selezione statistica di modelli
best-fit di sostituzione di nucleotide. Implementa cinque differenti
strategie di selezione dei modelli: test di tasso di probabilità dinamica e
gerarchica (dLRT e hLRT), criteri di informazione bayesiana e Akaike (BIC e
AIC) e un metodo della teoria della decisione (DT). Fornisce anche stima
dell'incertezza della selezione del modello, importanze dei parametri e
stime dei parametri mediate sul modello, incluse topologie dell'albero
mediate sul modello. jModelTest 2 include funzionalità per High Performance
Computing (HPC) e funzionalità aggiuntive come nuove strategie per
l'ottimizzazione dell'albero, alberi filogenetici mediati sul modello (sia
topologia sia lunghezza del ramo), filtraggio euristico e registrazione
automatica dell'attività dell'utente.
