HPC-udvalg af modeller for nukleotid substitution
jModelTest er et værktøj til at udføre statistisk valg af bedst egnede
modeller for nukleotidsubstitution. Værktøjet gennemfører fem forskellige
modelselektionsstrategier: hierarkiske og dynamiske
sandsynlighedskvotienttest (hLRT og dLRT), Akaike og bayesianske
oplysningskriterier (AIC og BIC), og en beslutningsteorimetode (DT). Det
giver også skøn over modeludvælgelsesusikkerheden, parametervigtighed og
model-gennemsnit parameterestimater, herunder model-gennemsnit for
trætopologier. jModelTest 2 omfatter High Performance Computing-funktioner
(HPC) og ekstra funktioner som nye strategier for træoptimering, model-
gennemsnit fylogenetiske træer (både topologi- og grenlængde), heuristisk
filtrering og automatisk logning af brugeraktivitet.
