Package: python-pbalign (0.3.2-1)

[ Source: pbalign  ]

mappa letture Pacific Biosciences a sequenze di DNA di riferimento (Python 2)

pbalign allinea letture PacBio a sequenze di riferimento, filtra letture allineate in accordo ai criteri di filtraggio specificati dall'utente e converte l'output sia nel formato SAM sia nel formato Compare HDF5 di PacBio (ad esempio .cmp.h5).

pbalign fa parte della suite SMRTAnalysis. Questo pacchetto fornisce il backend per la libreria Python.

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• rec: hdf5-tools

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Strumenti binari

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• sug: gmap

  allineamento tollerante agli SNP e con splicing per mRNA e letture corte

• sug: pbalign-doc

  documentazione per pbalign

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