Package: tophat (2.1.1+dfsg1-2 and others)

[ Source: tophat  ]

veloce mappatore di giunzioni di splice per letture RNA-Seq

TopHat allinea sequenze RNA-Seq in genomi della dimensione di quelli dei mammiferi, usando l'allineatore di letture corte per grandissime quantità di dati Bowtie, e successivamente analizza i risultati della mappatura per identificare giunzioni di splice tra gli esoni. TopHat è uno sforzo collaborativo tra il Center for Bioinformatics and Computational Biology dell'Università del Maryland e i Departments of Mathematics and Molecular and Cell Biology dell'Università della California, Berkeley.

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• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.1.1+dfsg1-2+b1	654.2 kB	3,832.0 kB	[list of files]