Package: sniffles (1.0.11+ds-1)

[ Source: sniffles  ]

strumento per identificare varianti strutturali usando sequenziamento di terza generazione

Sniffles è uno strumento per identificare varianti strutturali (SV) usando dati di sequenziamento di terza generazione come quelli delle piattaforme Pacific Biosciences o Oxford Nanopore. Rileva tutti i tipi di SV usando allineamenti di letture divise, regioni con elevata non corrispondenza e analisi di copertura come indizi.

Other Packages Related to sniffles

• dep: libbamtools2.5.1

  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	186.2 kB	621.0 kB	[list of files]