Package: sniffles (1.0.11+ds-1)

[ Source: sniffles  ]

Strukturel variationskalder der bruger tredjegenerations sekventering

Sniffles er en strukturel variationskalder (SV), der bruger tredjegenerations sekventeringsdata såsom dem fra Pacific Biosciences- eller Oxford Nanopore-platforme. Programmet registrerer alle typer af SV'er via bevis fra delt-læst sammenligninger, høj mismatch regioner og dækningsanalyse.

Other Packages Related to sniffles

• dep: libbamtools2.5.1

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

Download sniffles

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	186.2 kB	621.0 kB	[list of files]