Package: python-biotools (1.2.12-3)

[ Source: python-biotools  ]

utilità bioinformatiche per Python per sequenziamento genomico ad alte prestazioni

Questo pacchetto contiene utilità come:

 biotools.align - allinea sequenze (ibrido tra Needleman-Wunsch e
                  Smith-Waterman che è usato per trovare la sottosequenza
                  all'interno di una sequenza più grande che meglio si
                  allinea ad un riferimento);
 biotools.annotation - crea file di annotazioni. Le annotazioni possono
                       essere usate per creare una gerarchia tra le
                       annotazioni;
 biotools.BLAST - gestisce database BLAST e si interfaccia con il
                  programma autonomo BLAST+ disponibile da NCBI;
 biotools.clustal - interfaccia a clustalw global (allineamento di
                    sequenze multiple nucleotidiche o peptidiche);
 biotools.complement - crea il complementare di una sequenza, che può poi
                       essere invertito;
 biotools.sequence - vari strumenti per lavorare con sequenze;
 biotools.translate - traduce un nucleotide usando il codice genetico
                      standard.

Questo pacchetto contiene il modulo per Python 2.

Other Packages Related to python-biotools

• dep: clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

• dep: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

  or ncbi-blast+-legacy

  script per vecchia chiamata a NCBI Blast

• dep: python

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

• dep: python-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab

• dep: python-numpy

  aggiunge una veloce struttura per array al linguaggio Python

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