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[ Source: pairtools  ]

Package: python3-pairtools-dbg (0.3.0-2 and others)

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elabora dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C (compilazione di debug)

File di debug per python3-pairtools, un'infrastruttura a riga di comando semplice e veloce per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C.

Elabora allineamenti di sequenze a terminali appaiati ed effettua le seguenti operazioni:

 - rileva giunzioni di legatura (alias coppie Hi-C) in sequenze allineate,
   a terminali accoppiati, di molecole di DNA Hi-C;
 - ordina file .pairs per analisi successive;
 - rileva, applica tag e rimuove duplicati di PCR/ottici;
 - genera statistiche esaurienti su insiemi di dati Hi-C;
 - seleziona coppie Hi-C in base a criteri definiti in modo flessibile;
 - ripristina allineamenti .sam da coppie Hi-C.

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armel 0.3.0-2+b2 679.8 kB1,589.0 kB [list of files]
armhf 0.3.0-2+b2 686.4 kB1,537.0 kB [list of files]
i386 0.3.0-2+b2 672.5 kB1,545.0 kB [list of files]
mips64el 0.3.0-2+b2 716.3 kB2,079.0 kB [list of files]
mipsel 0.3.0-2+b2 688.9 kB1,639.0 kB [list of files]
ppc64el 0.3.0-2+b2 723.8 kB2,168.0 kB [list of files]
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