Package: r-bioc-ensembldb (2.14.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-ensembldb  ]

utilità per GNU R per creare e usare un database di annotazioni basato su Ensembl

Il pacchetto fornisce funzioni per creare ed usare database/pacchetti di annotazioni relative a trascritti. Le annotazioni per i database sono ottenute direttamente da Ensembl usando la sua API Perl. Le funzionalità e i dati sono simili a quelli dei pacchetti TxDb dal pacchetto GenomicFeatures, ma oltre a recuperare tutti i modelli e annotazioni per geni/trascritti dal database, il pacchetto ensembldb fornisce anche un'infrastruttura per filtri che permette di recuperare annotazioni per voci specifiche come geni codificati su una regione di cromosoma o modelli di trascritti di geni lincRNA.

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