Package: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-4)

[ Source: libgkarrays  ]

libreria per interrogare grandi collezioni di sequenze NGS

Gli Gk-array vengono forniti come libreria C++ facile da usare dedicata alle interrogazioni di grandi collezioni di sequenze, come quelle prodotte da sequenziatori ad alte prestazioni (es. HiSeq 2000 da Illumina, 454 da Roche).

Gli Gk-array indicizzano i k-meri delle letture e permettono di rispondere a diverse interrogazioni su quella collezione di letture (es. quante letture condividono questo k-mero? dove è presente questo k-mero nella collezione di letture?).

Gli Gk-array rappresentano un'alternativa efficiente alle tabelle hash in termini di spazio, pur essendo simili in termini di tempi di interrogazione.

Tags: Role: Shared Library

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Download libgkarrays1

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	55.4 kB	171.0 kB	[list of files]
arm64	51.3 kB	154.0 kB	[list of files]
armel	51.7 kB	142.0 kB	[list of files]
armhf	50.7 kB	126.0 kB	[list of files]
i386	61.9 kB	178.0 kB	[list of files]
mips64el	55.0 kB	180.0 kB	[list of files]
mipsel	60.8 kB	177.0 kB	[list of files]
ppc64el	58.1 kB	243.0 kB	[list of files]
s390x	51.9 kB	166.0 kB	[list of files]