Paquet : libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-4)

[ Paquet source : libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libgkarrays1

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libgkarrays1

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	55,4 ko	171,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	51,3 ko	154,0 ko	[liste des fichiers]
armel	51,7 ko	142,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	50,7 ko	126,0 ko	[liste des fichiers]
i386	61,9 ko	178,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	55,0 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	60,8 ko	177,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	58,1 ko	243,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	51,9 ko	166,0 ko	[liste des fichiers]