Package: dialign-tx (1.0.2-14 and others)

[ Source: dialign-t  ]

allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

DIALIGN-TX è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze proteiche o di DNA. È una completa reimplementazione dell'approccio basato su segmenti che include diverse nuove migliorie e modelli euristici che migliorano significativamente la qualità degli allineamenti in output rispetto a DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Per l'allineamento di coppie, DIALIGN-TX usa un algoritmo di concatenazione dei frammenti che favorisce catene di allineamenti locali a basso punteggio rispetto a frammenti isolati ad alto punteggio. Per gli allineamenti multipli, DIALIGN-TX usa una procedura migliorata che è meno sensibile a somiglianze spurie tra sequenze locali.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-14)

  allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti (file dei dati)

• dep: libc6 (>= 2.33) [not amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64]

• enh: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

Download dialign-tx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.2-14+b1	84.6 kB	218.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.2-14	85.7 kB	192.0 kB	[list of files]
armel	1.0.2-14	67.9 kB	184.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.2-14	63.2 kB	136.0 kB	[list of files]
i386	1.0.2-14	75.8 kB	204.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.2-14	99.4 kB	248.0 kB	[list of files]
mipsel	1.0.2-14	89.4 kB	215.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.2-14	92.1 kB	213.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.2-14	71.2 kB	200.0 kB	[list of files]