Package: bowtie-examples (1.3.1-1)
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Debian Resources:
Download Source Package bowtie:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Ognyan Kulev (QA Page)
- Stephan Struckmann (QA Page)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Similar packages:
esempi per bowtie, l'allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente in termini di memoria
Questo pacchetto affronta il problema di interpretare i risultati delle più recenti (2010) tecnologie di sequenziamento del DNA. Esse restituiscono pezzi piuttosto corti che non possono essere interpretate direttamente. La sfida per gli strumenti come Bowtie è quella di fornire una posizione nei cromosomi per i brevi frammenti di DNA sequenziati in ogni corsa.
Bowtie allinea sequenze (letture) brevi di DNA al genoma umano a una velocità di oltre 25 milioni di 35 bp all'ora. Bowtie indicizza il genoma con un indice Burrows-Wheeler per mantenere piccola la propria impronta di memoria: tipicamente circa 2,2 GB per il genoma umano (2,9 GB per le estremità accoppiate).
Questo pacchetto fornisce alcuni dati d'esempio per lavorare con bowtie.
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Download bowtie-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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| all | 6,159.4 kB | 6,768.0 kB | [list of files] |