allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione
Probalign usa stime della probabilità a posteriori della funzione di
ripartizione per calcolare allineamenti di sequenze multiple con la massima
accuratezza attesa. Funziona in modo migliore rispetto ai programmi di
allineamento più usati Probcons v1.1, MAFFT v5.851 e MUSCLE v3.6 nei test
di prestazione BAliBASE 3.0, HOMSTRAD e OXBENCH, e tale miglioramento è
statisticamente significativo. I miglioramenti di Probalign sono maggiori
negli insiemi di dati che contengono estensioni terminali N/C e in quelli
con sequenze di lunghezze elevate ed eterogenee. Negli insiemi di dati con
lunghezze eterogenee contenenti ripetizioni, l'accuratezza degli
allineamenti di Probalign è del 10% e il 15% maggiore rispetto agli altri
tre metodi, quando la deviazione standard della lunghezza è almeno 300 e 400.
