Package: megadepth (1.2.0-4)

[ Source: megadepth  ]

calcola la copertura da file di sequenziamento BigWig e BAM

Una delle principali preoccupazioni nell'interpretazione di sequenziamenti di DNA e RNA (!) è il numero di letture che coprono una particolare area. Questo pacchetto ha statistiche interessanti per la distinzione tra parti codificanti e non codificanti del genoma e sa come interpretare trascritti che si estendono su più esoni.

Questo pacchetto è un successore del programma "bamcount".

Other Packages Related to megadepth

• dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)

  C library for handling bigWig files

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: r-bioc-megadepth

  BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	68.7 kB	273.0 kB	[list of files]