Paquet : libbifrost-dev (1.3.1-1 et autres)

[ Paquet source : bifrost  ]

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Autres paquets associés à libbifrost-dev

• dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1) [non arm64]

  library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

  dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1+b1) [arm64]

Télécharger libbifrost-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.3.1-1	588,8 ko	3 858,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.3.1-1+b1	576,0 ko	3 803,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.3.1-1	612,3 ko	4 463,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.3.1-1	619,4 ko	4 138,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.3.1-1	1 790,5 ko	18 705,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.3.1-1	610,5 ko	4 019,0 ko	[liste des fichiers]