Paquet : tm-align (20190822+dfsg-3 et autres)

[ Paquet source : tm-align  ]

alignement structurel de protéines

TM-align est un algorithme pour l'alignement de structures de protéines utilisant la programmation dynamique. L'évaluation est effectuée par la matrice de rotation TM-score. L'algorithme est similaire à RMSD dans le fait que les portions non alignées de la structure influencent moins l'évaluation que les régions conservées plus structurées.

Étiquettes: Rôle: Programme

Autres paquets associés à tm-align

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, ppc64el, sparc64, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [ia64]

  Paquet indisponible

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  bibliothèque d'exécution pour les applications Fortran GNU

• sug: pymol

  système de graphismes moléculaires

• sug: rasmol

  visualisation de macromolécules biologiques

• enh: t-coffee

  alignement multiple de séquences

Télécharger tm-align

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	858,3 ko	1 393,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	20190822+dfsg-3	846,3 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	20190822+dfsg-3	844,4 ko	1 392,0 ko	[liste des fichiers]
armel	20190822+dfsg-3	850,3 ko	1 346,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	20190822+dfsg-3	847,0 ko	1 299,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	856,1 ko	1 344,0 ko	[liste des fichiers]
i386	20190822+dfsg-3	844,4 ko	1 346,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	20190822+dfsg-2	869,5 ko	1 507,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	840,2 ko	1 358,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	20190822+dfsg-3	845,8 ko	1 395,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	848,2 ko	1 392,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	20190822+dfsg-3	849,3 ko	1 392,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	20190822+dfsg-3	850,1 ko	1 312,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	20190822+dfsg-3	852,7 ko	1 340,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	866,8 ko	1 391,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	852,3 ko	3 250,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	20190822+dfsg-3	846,5 ko	1 339,0 ko	[liste des fichiers]