Paketti: tm-align (20190822+dfsg-3 ja muut)

[ Source: tm-align  ]

structural alignment of proteins

TM-align is a computer algorithm for protein structure alignment using dynamic programming. The scoring is performed by the TM-score rotation matrix. This is similar to the RMSD in that unaligned portions of the structure influence the scoring less than the more structurally conserved regions.

Tagit: Role: Program

Muut pakettiin tm-align liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.29) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, ppc64el, sparc64, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [ia64]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

• sug: rasmol

  visualization of biological macromolecules

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Imuroi tm-align

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-2	861.6 kt	1,371.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	20190822+dfsg-3	846.3 kt	1,344.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	20190822+dfsg-3	844.4 kt	1,392.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	20190822+dfsg-3	850.3 kt	1,346.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	20190822+dfsg-3	847.0 kt	1,299.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	856.1 kt	1,344.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	20190822+dfsg-3	844.4 kt	1,346.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-2	869.5 kt	1,507.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	840.2 kt	1,358.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	20190822+dfsg-3	845.8 kt	1,395.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	848.2 kt	1,392.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	20190822+dfsg-3	849.3 kt	1,392.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	20190822+dfsg-3	850.1 kt	1,312.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	20190822+dfsg-3	852.7 kt	1,340.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	866.8 kt	1,391.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	852.3 kt	3,250.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	20190822+dfsg-3	846.5 kt	1,339.0 kt	[tiedostoluettelo]