Paquet : r-bioc-gsva (1.52.3+ds-1 et autres)
Liens pour r-bioc-gsva
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-gsva :
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds-1.dsc]
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds.orig.tar.xz]
- [r-bioc-gsva_1.52.3+ds-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
Gene Set Variation Analysis for microarray and RNA-seq data
Gene Set Variation Analysis (GSVA) is a non-parametric, unsupervised method for estimating variation of gene set enrichment through the samples of a expression data set. GSVA performs a change in coordinate systems, transforming the data from a gene by sample matrix to a gene- set by sample matrix, thereby allowing the evaluation of pathway enrichment for each sample. This new matrix of GSVA enrichment scores facilitates applying standard analytical methods like functional enrichment, survival analysis, clustering, CNV-pathway analysis or cross- tissue pathway analysis, in a pathway-centric manner.
Autres paquets associés à r-bioc-gsva
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- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.3.4) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16 [x32]
- Paquet indisponible
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- dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]
- Paquet indisponible
-
- dep: r-api-bioc-3.19 [non hppa, ia64, sh4, x32]
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
-
- dep: r-bioc-biobase [hppa, ia64, sh4, x32]
- fonctions de base pour Bioconductor
- dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-biocparallel [hppa, ia64, sh4, x32]
- BioConductor facilities for parallel evaluation
- dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-biocsingular [hppa, ia64, sh4, x32]
- décomposition en valeurs singulières pour les paquets de Bioconductor
- dep: r-bioc-biocsingular (>= 1.20.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-delayedarray [hppa, ia64, sh4, x32]
- BioConductor delayed operations on array-like objects
- dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-delayedmatrixstats [hppa, ia64, sh4, x32]
- fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »
- dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-gseabase [hppa, ia64, sh4, x32]
- Gene set enrichment data structures and methods
- dep: r-bioc-gseabase (>= 1.66.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
-
- dep: r-bioc-hdf5array [hppa, ia64, sh4, x32]
- HDF5 backend for DelayedArray objects
- dep: r-bioc-hdf5array (>= 1.32.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-iranges [hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-s4vectors [hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-singlecellexperiment [hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- BioConductor summary statistics for rows and columns of sparse matrices
- dep: r-bioc-sparsematrixstats (>= 1.16.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-bioc-spatialexperiment (>= 1.14.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
- S4 Class for Spatially Resolved -omics Data
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- dep: r-bioc-summarizedexperiment [hppa, ia64, sh4, x32]
- BioConductor assay container
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0)
- paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
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- rec: r-cran-fastmatch
- GNU R package for fast match replacement for repeated look-ups
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- sug: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
- sug: r-bioc-edger (>= 4.2.0) [non hppa, ia64, sh4, x32]
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- sug: r-bioc-genefilter [hppa, ia64, sh4, x32]
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- paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées
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- sug: r-cran-shinyjs
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Télécharger r-bioc-gsva
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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alpha (portage non officiel) | 1.52.3+ds-1 | 1 081,0 ko | 1 366,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 1.52.3+ds-1 | 1 080,6 ko | 1 314,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 1.52.3+ds-1 | 1 086,2 ko | 1 366,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 1.50.0+ds-1 | 1 071,2 ko | 1 291,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 1.50.0+ds-1 | 1 072,1 ko | 1 298,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 1.52.3+ds-1 | 1 088,2 ko | 1 366,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 1.52.3+ds-1 | 1 081,7 ko | 1 366,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 1.52.3+ds-1 | 1 081,5 ko | 1 366,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 1.52.3+ds-1 | 1 088,0 ko | 1 322,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 1.52.3+ds-1 | 1 080,9 ko | 1 314,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 1.50.0+ds-1 | 1 070,9 ko | 1 347,0 ko | [liste des fichiers] |
sparc64 (portage non officiel) | 1.52.3+ds-1 | 1 080,6 ko | 2 327,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 1.46.0+ds-1 | 781,0 ko | 911,0 ko | [liste des fichiers] |