Paquet : metabat (2.15-4 et autres)

[ Paquet source : metabat  ]

robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data

MetaBAT integrates empirical probabilistic distances of genome abundance and tetranucleotide frequency for accurate metagenome binning. MetaBAT outperforms alternative methods in accuracy and computational efficiency on both synthetic and real metagenome datasets. It automatically forms hundreds of high quality genome bins on a very large assembly consisting millions of contigs in a matter of hours on a single node.

Autres paquets associés à metabat

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [non i386]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2.15-4+b1	509,2 ko	1 880,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.15-4+b1	538,4 ko	1 923,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.15-4+b1	500,0 ko	1 706,0 ko	[liste des fichiers]