Pacote: metabat (2.15-4 e outros)

[ Fonte: metabat  ]

robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data

MetaBAT integrates empirical probabilistic distances of genome abundance and tetranucleotide frequency for accurate metagenome binning. MetaBAT outperforms alternative methods in accuracy and computational efficiency on both synthetic and real metagenome datasets. It automatically forms hundreds of high quality genome bins on a very large assembly consisting millions of contigs in a matter of hours on a single node.

Outros pacotes relacionados a metabat

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [não i386]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de metabat

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2.15-4+b1	509.2 kB	1,880.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.15-4+b1	538.4 kB	1,923.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	2.15-4+b1	500.0 kB	1,706.0 kB	[lista de arquivos]