Paquet : libgkarrays1t64 (2.1.0+dfsg-4.2 et autres)

[ Paquet source : libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Autres paquets associés à libgkarrays1t64

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Télécharger libgkarrays1t64

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	59,5 ko	248,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.1.0+dfsg-4.2	56,2 ko	174,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1.0+dfsg-4.2+b1	53,1 ko	247,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.1.0+dfsg-4.2	52,5 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.1.0+dfsg-4.2	51,6 ko	133,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	69,2 ko	193,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.1.0+dfsg-4.2	62,7 ko	185,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	70,0 ko	247,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	60,7 ko	181,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.1.0+dfsg-4.2	55,0 ko	255,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	59,0 ko	247,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1.0+dfsg-4.2	58,1 ko	246,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1.0+dfsg-4.2	57,7 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1.0+dfsg-4.2	52,5 ko	173,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	64,2 ko	246,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	50,0 ko	2 107,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.1.0+dfsg-4.2	56,7 ko	169,0 ko	[liste des fichiers]