Paquet : coot (1.1.15+dfsg-1)

[ Paquet source : coot  ]

model building program for macromolecular crystallography

This is a program for constructing atomic models of macromolecules from x-ray diffraction data. Coot displays electron density maps and molecular models and allows model manipulations such as idealization, refinement, manual rotation/translation, rigid-body fitting, ligand search, solvation, mutations, rotamers. Validation tools such as Ramachandran and geometry plots are available to the user. This package provides a Coot build with embedded Python support.

Autres paquets associés à coot

• dep: coot-data

  various data files needed by Coot

• dep: gir1.2-gtk-4.0

  bibliothèque d'interface utilisateur graphique GTK –⋅interface gir

• dep: libasound2t64 (>= 1.0.16)

  bibliothèque partagée pour les applications ALSA
  un paquet virtuel est également fourni par liboss4-salsa-asound2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [loong64, mips64el, riscv64]

  bibliothèque de prise en charge fournissant des fonctions internes __atomic

• dep: libblas3

  implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée

  ou libblas.so.3

  paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliothèque Boost.Python

• dep: libboost-python1.83.0-py313

  paquet virtuel fourni par libboost-python1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.38) [non loong64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libcairo2 (>= 1.6.0)

  Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libcootapi1.1 (>= 1.1.15+dfsg)

  shared library for coot

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libepoxy0 (>= 1.3)

  bibliothèque de gestion de pointeurs de fonction OpenGL

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  moteur de fontes FreeType 2, fichiers de bibliothèques partagées

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.31.1)

  bibliothèque GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.80.0)

  bibliothèque GLib de routines C

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libgraphene-1.0-0 (>= 1.5.4)

  library of graphic data types

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgtk-4-1 (>= 4.13.8)

  bibliothèque d'interface graphique utilisateur GTK

• dep: libmmdb2-0 (>= 2.0.22)

  macromolecular coordinate library - runtime

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Mise en place et rendu de texte internationalisé

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Mise en place et rendu de texte internationalisé

• dep: libpng16-16t64 (>= 1.6.46)

  bibliothèque PNG –⋅exécutable (version⋅1.6)

• dep: libpython3.13 (>= 3.13.0~rc3)

  Shared Python runtime library (version 3.13)

• dep: librdkit1t64 (>= 202409.6)

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libssm2 (>= 1.4.0)

  macromolecular superposition library - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libvorbisfile3 (>= 1.1.2)

  API de haut niveau pour le codec de compression audio général Vorbis

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-gi

  interfaçage avec Python 3 pour les bibliothèques gobject-introspection

• dep: python3-rdkit

  Collection of cheminformatics and machine-learning software

• dep: refmac-dictionary

  dictionary for macromolecular refinement and model building

• dep: sfftw2 (>= 2.1.5)

  library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Bibliothèque de compression - binaires

• sug: coot-doc

  documentation for Coot

Télécharger coot

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	9 076,5 ko	34 530,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	7 899,6 ko	32 934,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	8 172,7 ko	33 440,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	7 723,7 ko	37 330,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	8 965,0 ko	38 820,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	8 683,1 ko	27 361,0 ko	[liste des fichiers]