Paket: coot (1.1.15+dfsg-1)

[ Quellcode: coot  ]

model building program for macromolecular crystallography

This is a program for constructing atomic models of macromolecules from x-ray diffraction data. Coot displays electron density maps and molecular models and allows model manipulations such as idealization, refinement, manual rotation/translation, rigid-body fitting, ligand search, solvation, mutations, rotamers. Validation tools such as Ramachandran and geometry plots are available to the user. This package provides a Coot build with embedded Python support.

Andere Pakete mit Bezug zu coot

• dep: coot-data

  various data files needed by Coot

• dep: gir1.2-gtk-4.0

  GTK-Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen -- gir-Anbindung

• dep: libasound2t64 (>= 1.0.16)

  Laufzeitbibliothek für ALSA-Anwendungen
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch liboss4-salsa-asound2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [loong64, mips64el, riscv64]

  Hilfsbibliothek, die atomare (__atomic) Built-in-Funktionen zur Verfügung stellt

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)

  Die Bibliothek Boost.Python

• dep: libboost-python1.83.0-py313

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libboost-python1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht loong64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libcairo2 (>= 1.6.0)

  2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libcootapi1.1 (>= 1.1.15+dfsg)

  shared library for coot

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libepoxy0 (>= 1.3)

  Bibliothek zur Verwaltung von Zeigern auf OpenGL-Funktionen

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Schrift-Engine FreeType 2, Laufzeitbibliothek

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.31.1)

  Bibliothek GDK-PixBuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.80.0)

  GLib - Bibliothek von C-Routinen

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgraphene-1.0-0 (>= 1.5.4)

  Bibliothek grafischer Datentypen

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libgtk-4-1 (>= 4.13.8)

  GTK - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen

• dep: libmmdb2-0 (>= 2.0.22)

  macromolecular coordinate library - runtime

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes

• dep: libpng16-16t64 (>= 1.6.46)

  PNG-Bibliothek - Laufzeit (Version 1.6)

• dep: libpython3.13 (>= 3.13.0~rc3)

  Shared Python runtime library (version 3.13)

• dep: librdkit1t64 (>= 202409.6)

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3

• dep: libssm2 (>= 1.4.0)

  Bibliothek zur Überlagerung von Makromolekülen - Laufzeit

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libvorbisfile3 (>= 1.1.2)

  Vorbis General Audio Compression Codec - leistungsstarke API

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-gi

  Python-3-Anbindungen für GObject-Introspektionsbibliotheken

• dep: python3-rdkit

  Collection of cheminformatics and machine-learning software

• dep: refmac-dictionary

  dictionary for macromolecular refinement and model building

• dep: sfftw2 (>= 2.1.5)

  library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• sug: coot-doc

  documentation for Coot

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	9.076,5 kB	34.530,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	7.899,6 kB	32.934,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	8.172,7 kB	33.440,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	7.723,7 kB	37.330,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	8.965,0 kB	38.820,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	8.683,1 kB	27.361,0 kB	[Liste der Dateien]