Paquet : bio-eagle (2.4.1-3 et autres)
Liens pour bio-eagle
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
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- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
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Responsables :
Ressources externes :
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Paquets similaires :
phasage d'haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence
Eagle estime la phase haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence. L'idée de base de l'algorithme Eagle1 est d'utiliser l'identité par descendance parmi les parents éloignés – qui est invasive pour de grandes tailles d'échantillons, mais rare parmi de faibles nombres d'échantillons – pour appeler rapidement une phase grâce à une approche de score rapide. Au contraire, l'algorithme Eagle2 analyse un modèle probabiliste complet similaire au modèle diploïde Li-Stephens utilisé par les méthodes antérieures basées sur des modèles de Markov cachés.
Note : l'exécutable a été renommé bio-eagle à cause d'un conflit de nommage. Plus d'informations sont disponibles dans /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.
Autres paquets associés à bio-eagle
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- bibliothèque Boost.Iostreams
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libopenblas0
- Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- rec: med-config (>= 2.1)
- paquet de configuration générale de Debian Med
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- sug: bio-eagle-examples
- exemples pour bio-eagle
Télécharger bio-eagle
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 2.4.1-3+b1 | 244,9 ko | 674,0 ko | [liste des fichiers] |