Paketti: libssw0 (1.1-14 ja muut)

[ Source: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libssw0 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libssw0

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.1-14+b1	20.7 kt	56.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1-14+b1	19.1 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1-14+b1	20.2 kt	60.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1-14+b1	20.7 kt	52.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1-14+b1	25.3 kt	80.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1-14+b1	24.9 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1-14+b1	19.7 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1-14+b1	25.0 kt	68.0 kt	[tiedostoluettelo]