Paketti: hts-nim-tools (0.2.1-1) [debports]
Links for hts-nim-tools
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check
This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.
These new tools are
• bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file • vcf-check : check regions of a VCF against a background for missing chunks
and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.
Muut pakettiin hts-nim-tools liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: nim-hts-dev
- wrapper for hts C library
Imuroi hts-nim-tools
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
ppc64 (epävirallinen siirros) | 155.9 kt | 981.0 kt | [tiedostoluettelo] |