Paketti: perm (0.4.0-7)

[ Source: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Muut pakettiin perm liittyvät paketit

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  utility functions from BSD systems - shared library

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi perm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	126.1 kt	348.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	113.0 kt	316.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	108.4 kt	299.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	112.7 kt	227.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	141.7 kt	399.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	128.7 kt	481.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	133.3 kt	445.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	130.3 kt	412.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	114.0 kt	352.0 kt	[tiedostoluettelo]