Paketti: perm (0.4.0-8 ja muut)

[ Source: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Muut pakettiin perm liittyvät paketit

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  utility functions from BSD systems - shared library

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei arm64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ei arm64, riscv64]

Imuroi perm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.4.0-8+b1	124.4 kt	337.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.4.0-8+b2	114.6 kt	348.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.4.0-8+b1	108.0 kt	348.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.4.0-8+b1	111.8 kt	284.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.4.0-8+b1	141.8 kt	392.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.4.0-8+b1	127.2 kt	502.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.4.0-8+b1	132.1 kt	477.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.4.0-8+b1	133.5 kt	292.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.4.0-8+b1	113.2 kt	345.0 kt	[tiedostoluettelo]