Pacote: perm (0.4.0-7)

[ Fonte: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Outros pacotes relacionados a perm

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  funções utilitárias de sistemas BSD - biblioteca compartilhada

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el, mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de perm

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	126.1 kB	348.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	113.0 kB	316.0 kB	[lista de arquivos]
armel	108.4 kB	299.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	112.7 kB	227.0 kB	[lista de arquivos]
i386	141.7 kB	399.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	128.7 kB	481.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	133.3 kB	445.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	130.3 kB	412.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	114.0 kB	352.0 kB	[lista de arquivos]