Paketti: sibsim4 (0.20-5)

[ Source: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Muut pakettiin sibsim4 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

Imuroi sibsim4

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	29.7 kt	73.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	28.1 kt	73.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	27.5 kt	72.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	26.2 kt	56.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	30.8 kt	80.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	29.3 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	28.4 kt	78.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	31.9 kt	85.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	30.5 kt	77.0 kt	[tiedostoluettelo]