Paket: sibsim4 (0.20-5)

[ Quellcode: sibsim4  ]

Richtet exprimierte RNA-Sequenzen an einer DNA-Vorlage aus

Das SIBsim4-Projekt basiert auf sim4, einem Programm, das entwickelt wurde, um eine exprimierte DNA-Sequenz mit einer genomischen Sequenz abzustimmen um Intronen zu erlauben. SIBsim4 ist eine recht umfangreiche Neuerstellung des ursprünglichen Codes mit den folgenden Zielen:

 * Geschwindigkeitsverbesserung;
 * Einsetzbarkeit auf großen (Größenordnung von Chromosomen)
   DNA-Sequenzen;
 * detailliertere Ausgabe über Spleiß-Typen;
 * detailliertere Ausgabe über Poly(A)-Schwänze;
 * verschiedene Aufräumarbeiten und Verbesserungen des Codes.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::TODO, use::comparing, Suchen, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, ppc64el]

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	29,7 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	28,1 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	27,5 kB	72,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	26,2 kB	56,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	30,8 kB	80,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	29,3 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	28,4 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	31,9 kB	85,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	30,5 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]