Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-5)

[ Quellcode: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	136,6 kB	540,0 kB	[Liste der Dateien]