Paket: srst2 (0.2.0-13) [debports]
Links für srst2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket herunterladen:
Nicht gefundenBetreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [katholt.github.io]
Ähnliche Pakete:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Andere Pakete mit Bezug zu srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
-
- dep: cd-hit
- Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python-3-Bibliothek für die Bioinformatik
-
- dep: python3-scipy
- Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
srst2 herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 59,9 kB | 265,0 kB | [Liste der Dateien] |