Paket: smithwaterman (0.0+git20160702.2610e25-12 und andere)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

determine similar regions between two strings or genomic sequences

The Smith–Waterman algorithm performs local sequence alignment; that is, for determining similar regions between two strings or nucleotide or protein sequences. Instead of looking at the total sequence, the Smith–Waterman algorithm compares segments of all possible lengths and optimizes the similarity measure.

Andere Pakete mit Bezug zu smithwaterman

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, m68k, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht ia64, m68k]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64, m68k]
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

smithwaterman herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,7 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,1 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,4 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,0 kB	50,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	11,9 kB	50,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,8 kB	51,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,3 kB	62,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b1	14,8 kB	65,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12	12,9 kB	58,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,9 kB	100,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,3 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,2 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,3 kB	51,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,7 kB	55,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,4 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	12,2 kB	1.060,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.0+git20160702.2610e25-12+b2	13,0 kB	58,0 kB	[Liste der Dateien]