Paket: quorum (1.1.2-2 und andere)

[ Quellcode: quorum  ]

QUality Optimized Reads of genomic sequences

QuorUM enables to obtain trimmed and error-corrected reads that result in assemblies with longer contigs and fewer errors. QuorUM provides best performance compared to other published error correctors in several metrics. QuorUM is efficiently implemented making use of current multi- core computing architectures and it is suitable for large data sets (1 billion bases checked and corrected per day per core). The third-party assembler (SOAPdenovo) benefits significantly from using QuorUM error- corrected reads. QuorUM error corrected reads result in a factor of 1.1 to 4 improvement in N50 contig size compared to using the original reads with SOAPdenovo for the data sets investigated.

Andere Pakete mit Bezug zu quorum

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht arm64, ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht ia64, riscv64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0) [amd64, ia64]

  count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

  dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.1) [nicht amd64, ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht arm64, ia64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

quorum herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.1.2-2	114,5 kB	400,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1.2-2+b1	110,6 kB	557,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.1.1-5	136,1 kB	620,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.1.2-2+b2	115,7 kB	572,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.1.2-2+b2	116,7 kB	557,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.1.2-2+b2	114,6 kB	341,0 kB	[Liste der Dateien]