Paket: libjellyfish-2.0-2 (2.3.1-3 und andere)

Links für libjellyfish-2.0-2

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket jellyfish herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Shaun Jackman (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Michael R. Crusoe (QS-Seite)
Étienne Mollier (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [www.genome.umd.edu]

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Markierungen: Rolle: Laufzeit-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libjellyfish-2.0-2

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [nicht hppa, ia64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht hppa, ia64]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht ia64]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

libjellyfish-2.0-2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.3.1-3+b6	65,7 kB	205,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.3.1-3+b6	60,4 kB	221,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.3.1-2+b1	66,9 kB	208,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.3.0-12	75,2 kB	315,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.3.1-3+b6	60,6 kB	233,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.3.1-3+b6	69,5 kB	285,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.3.1-3+b6	64,5 kB	168,0 kB	[Liste der Dateien]