Pakiet: quorum (1.1.2-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: quorum  ]

QUality Optimized Reads of genomic sequences

QuorUM enables to obtain trimmed and error-corrected reads that result in assemblies with longer contigs and fewer errors. QuorUM provides best performance compared to other published error correctors in several metrics. QuorUM is efficiently implemented making use of current multi- core computing architectures and it is suitable for large data sets (1 billion bases checked and corrected per day per core). The third-party assembler (SOAPdenovo) benefits significantly from using QuorUM error- corrected reads. QuorUM error corrected reads result in a factor of 1.1 to 4 improvement in N50 contig size compared to using the original reads with SOAPdenovo for the data sets investigated.

Inne pakiety związane z quorum

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie arm64, ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie ia64, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0) [amd64, ia64]

  count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

  dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.1) [nie amd64, ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64, ia64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie quorum

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.1.2-2	114,5 KiB	400,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1.2-2+b1	110,6 KiB	557,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.1.1-5	136,1 KiB	620,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1.2-2+b2	115,7 KiB	572,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1.2-2+b2	116,7 KiB	557,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1.2-2+b2	114,6 KiB	341,0 KiB	[lista plików]