Paket: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]

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Experimentelles Paket

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Burrows-Wheeler Aligner

BWA (Burrows-Wheeler Aligner) ist ein Softwarepaket für das Abbilden gering abweichender Sequenzen auf eine große Referenzsequenz, etwa das menschliche Genom. Es besteht aus drei Algorithmen: BWA-backtrack, BWA-SW und BWA-MEM. BWA-backtrack ist für Illumina-Sequenz-Reads bis zu 100 Basenpaaren (bp) geeignet, während die anderen zwei Algorithmen für längere Sequenzen zwischen 70 bp und 1 Megabasenpaaren (Mbp) geeignet sind. BWA-MEM und BWA-SW teilen ähnliche Merkmale wie Unterstützung für lange Reads und Split-Alignments. BWA-MEM ist jedoch neuer und wird für hochqualitative Anfragen empfohlen, da es schneller und genauer ist. BWA-MEM ist zudem für Illumina-Reads mit einer Länge von 70 bis 100 bp leistungsfähiger als BWA-backtrack.

Andere Pakete mit Bezug zu bwa

• dep: libc6.1 (>= 2.36)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	291,1 kB	962,0 kB	[Liste der Dateien]