Paket: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]
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Externe Ressourcen:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Ähnliche Pakete:
Experimentelles Paket
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Burrows-Wheeler Aligner
BWA (Burrows-Wheeler Aligner) ist ein Softwarepaket für das Abbilden gering abweichender Sequenzen auf eine große Referenzsequenz, etwa das menschliche Genom. Es besteht aus drei Algorithmen: BWA-backtrack, BWA-SW und BWA-MEM. BWA-backtrack ist für Illumina-Sequenz-Reads bis zu 100 Basenpaaren (bp) geeignet, während die anderen zwei Algorithmen für längere Sequenzen zwischen 70 bp und 1 Megabasenpaaren (Mbp) geeignet sind. BWA-MEM und BWA-SW teilen ähnliche Merkmale wie Unterstützung für lange Reads und Split-Alignments. BWA-MEM ist jedoch neuer und wird für hochqualitative Anfragen empfohlen, da es schneller und genauer ist. BWA-MEM ist zudem für Illumina-Reads mit einer Länge von 70 bis 100 bp leistungsfähiger als BWA-backtrack.
Andere Pakete mit Bezug zu bwa
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- dep: libc6.1 (>= 2.36)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
bwa herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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ia64 (inoffizielle Portierung) | 291,1 kB | 962,0 kB | [Liste der Dateien] |