Paket: samtools (1.19.2-1 und andere) [debports]

[ Quellcode:  ]

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Andere Pakete mit Bezug zu samtools

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Laufzeitbibliotheken zur Terminalsteuerung

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  Systemnahe terminfo-Laufzeitbibliothek für die Terminalsteuerung

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• sug: cwltool

  Referenzimplemantation der Common Workflow Language

samtools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.19.2-1+b1	716,1 kB	2.112,0 kB	[Liste der Dateien]