[ Source: bowtie ]
Package: bowtie-examples (1.3.1-3)
Links for bowtie-examples
Debian Resources:
Download Source Package bowtie:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Ognyan Kulev (QA Page)
- Stephan Struckmann (QA Page)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Similar packages:
Eksempler for bowtie - den ultrahurtige og hukommelseseffektive short read-sammenligner
Denne pakke adresserer problemet med at fortolke resultaterne fra de seneste (2010) DNA-sekvensteknologier. Disse vil resultere i ret så korte stræk og disse kan ikke fortolkes direkte. Det er udfordringen for værktøjer såsom Bowtie at give en kromosonplacering til korte stræk af DNA sekventeret per kørsel.
Bowtie sammenligner korte DNA-sekvenser (læsninger) for den menneskelige arvemasse med en hastighed på mere end 25 millioner 35-bp læsninger per time. Bowtie indekserer arvemassen med et Burrows-Wheeler-indeks for at holde hukommelsesaftrykket lavt: Typisk omkring 2,2 GB for den menneskelige arvemasse (2,9 GB for paired-end).
Denne pakke tilbyder nogle eksempler på data, der fungerer sammen med bowtie.
Other Packages Related to bowtie-examples
|
|
|
|
-
- rec: bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- enh: bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
Download bowtie-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 6,156.7 kB | 6,765.0 kB | [list of files] |