Paket: bowtie-examples (1.3.1-3)
Links für bowtie-examples
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket bowtie herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Ognyan Kulev (QS-Seite)
- Stephan Struckmann (QS-Seite)
- Alexandre Mestiashvili (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Ähnliche Pakete:
Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen - Beispiele
Dieses Paket beschäftigt sich mit dem Problem die Resultate der neuesten (2010) DNA-Sequenziertechniken zu interpretieren. Diese Techniken ergeben ziemlich kurze Sequenzen, die nicht direkt interpretiert werden können. Es ist die Aufgabe für Werkzeuge wie Bowtie den chromosomalen Ort (Locus) der kurzen DNA-Sequenzen festzustellen.
Bowtie führt Alignments kurzer DNA-Sequenzen (Reads) mit dem menschlichen Genom durch, mit einer Rate von über 25 Millionen Reads (mit einer Länge von 35 Basenpaaren) pro Stunde. Bowtie indiziert das Genom mit einer Burrows-Wheeler-Transformation, um den Speicherverbrauch gering zu halten; normalerweise etwa 2,2 GB für das menschliche Genom (2,9 GB für »paired- end«).
Dieses Paket stellt Beispieldaten für die Arbeit mit Bowtie bereit.
Andere Pakete mit Bezug zu bowtie-examples
|
|
|
|
-
- rec: bowtie
- Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
-
- enh: bowtie
- Ultraschnelles und speichersparendes Alignmentprogramm für kurze DNA-Sequenzen
bowtie-examples herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| all | 6.156,7 kB | 6.765,0 kB | [Liste der Dateien] |