Package: ltrsift (1.0.2-10 and others)

[ Source: ltrsift  ]

Efterbehandling og klassifikation af LTR-retrotransposons

LTRsift er et grafisk skrivebordsværktøj for semiautomatisk efterbehandling af de novo-forudsagte LTR-retrotransposon annotationer, såsom dem oprettet af LTRharvest og LTRdigest. Dets brugervenlige grænseflade viser LTR-retrotransposon kandidater, deres putative familier og deres interne struktur på en hierarkisk måde, der giver brugeren mulighed for at »sift« igennem de undertiden omfangsrige resultater i de novo-forudsigelsesprogrammer. Værktøjet tilbyder også tilpasset filtrering og klassifikationsfunktionalitet.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Other Packages Related to ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D - vektorgrafikbibliotek

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf-bibliotek

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  Alsidigt genomanalysebibliotek

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [not arm64]

  GLib-bibliotek for C-rutiner

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [arm64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  Grafisk brugergrænsefladebibliotek til GTK - ældre version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout og optegning af internationaliseret tekst

• rec: last-align

  sammenligning af biologisk sekvenser på genom-skala

• rec: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

Download ltrsift

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.2-10	96.6 kB	364.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.2-10+b1	88.9 kB	465.0 kB	[list of files]
armel	1.0.2-10	87.6 kB	326.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.2-10	87.5 kB	278.0 kB	[list of files]
i386	1.0.2-10	106.3 kB	410.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.2-10	83.3 kB	479.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.2-10	98.0 kB	464.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.2-10	95.9 kB	316.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.2-10	90.7 kB	364.0 kB	[list of files]