Пакет: ltrsift (1.0.2-10 и други)

[ Източник: ltrsift  ]

postprocessing and classification of LTR retrotransposons

LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations, such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates, their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift" through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification functionality.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: GTK, Purpose: use::analysing, use::browsing, Comparing, Data Organisation, use::viewing, x11::application

Други пакети, свързани с ltrsift

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0)

  GDK Pixbuf library

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [не arm64]

  GLib library of C routines

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [arm64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.18.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout and rendering of internationalized text

• rec: last-align

  genome-scale comparison of biological sequences

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

Изтегляне на ltrsift

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.0.2-10	96,6 кБ	364,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.2-10+b1	88,9 кБ	465,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0.2-10	87,6 кБ	326,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.2-10	87,5 кБ	278,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.2-10	106,3 кБ	410,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0.2-10	83,3 кБ	479,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.2-10	98,0 кБ	464,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0.2-10	95,9 кБ	316,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.2-10	90,7 кБ	364,0 кБ	[списък на файловете]