[ Source: nanopolish ]
Package: nanopolish (0.14.0-1 and others)
Links for nanopolish
Debian Resources:
Download Source Package nanopolish:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata
Nanoplish bruger en skjult Markovmodel på signalniveau til konsensuskald af nanospores genomsekvensdata. Programmet kan udføre analyse på signalniveau for Oxford Nanopore-sekvensdata. Nanopolish kan beregne en forbedret konsensussekvens for en kladdegenomsamling, registrere baseændringer, kalde SNP'er og indels med respekt for et referencegenom med mere.
Other Packages Related to nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)
- HDF5 C-kørselstidsfiler - seriel version
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- Hurtig heltalskompression i C via StreamVByte-kodningen
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- rec: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
Download nanopolish
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
i386 | 0.14.0-1+b2 | 2,171.1 kB | 9,713.0 kB | [list of files] |