Package: eigensoft (8.0.0+dfsg-2 and others)

[ Source: eigensoft  ]

Reduktion af befolkningsbias for genetiske analyser

Pakken EIGENSOFT kombinerer funktionalitet fra gruppens befolkningsgenetiske metoder (Patterson et al. 2006) og deres EIGENSTRAT-startifikationsmetode (Price et al. 2006). Metoden EIGENSTRAT bruger principielle komponentanalyse til eksplicit at vise forfaderforskelle mellem tilfælde og kontroller langs fortsættende akser af variation; den medfølgende korrektion er specifik til en kandidats markørs variation i frekvens på tværs af forfaderbefolkninger, minimerer uægte associationer mens funktionen for detektion af korrekte associationer forstærkes. Pakken EIGENSOFT har et indbygget plotskript og understøtter flere filformater og kvantitative fænotyper.

Other Packages Related to eigensoft

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) - bibliotekspakke

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - C lib-delt version

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• rec: gnuplot

  Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

Download eigensoft

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	8.0.0+dfsg-2+b1	506.9 kB	3,922.0 kB	[list of files]
arm64	8.0.0+dfsg-2+b1	471.2 kB	4,386.0 kB	[list of files]
armel	8.0.0+dfsg-2+b1	406.4 kB	3,585.0 kB	[list of files]
armhf	8.0.0+dfsg-2+b1	394.2 kB	2,741.0 kB	[list of files]
i386	8.0.0+dfsg-2+b1	500.3 kB	3,848.0 kB	[list of files]
mips64el	8.0.0+dfsg-2+b1	473.2 kB	4,672.0 kB	[list of files]
ppc64el	8.0.0+dfsg-2+b1	533.6 kB	5,474.0 kB	[list of files]
riscv64	8.0.0+dfsg-2+b1	506.6 kB	3,406.0 kB	[list of files]
s390x	8.0.0+dfsg-2+b1	507.6 kB	4,614.0 kB	[list of files]